农业生产中常见的微生物菌剂（已登记菌剂）
一、芽孢杆菌
芽孢杆菌是一群好氧或兼性厌氧、产芽孢的革兰氏阳性杆菌的总称，其生理特征丰富多样，分布极其广泛，是土壤和植物体表根际的重要微生物种群。芽孢杆菌突出的特征是能产生耐热抗逆的芽孢，这有利于生防菌剂的生产、剂型加工及在环境中存活、定殖与繁殖。田间应用研究已经证实芽孢杆菌生防菌剂在稳定性、与化学农药的相容性和在不同植物不同年份防效的一致性等方面，明显优于非芽孢杆菌和真菌生防菌剂。
1、胶冻样类芽孢杆菌（Paenibacillus mucilaginosus）
亚历山大罗夫将能够分解硅酸盐矿物中钾元素的细菌命名为胶冻样芽孢杆菌或胶质芽孢杆菌（Bacillus mucilaginosus）。胶冻样类芽孢杆菌是一种能分解硅酸盐矿物的细菌，因此一些学者把它称为硅酸盐细菌。由于该菌种能分解钾长石、云母等铝硅酸盐类的原生质态矿物，使土壤中的不溶性K、P、Si等转变为可溶性元素供植物利用，同时还可产生多种生物活性物质，促进植物生长。胶质芽胞杆菌还具有固氮能力和PGPR作用（在植物根际生活的一类具有刺激植物生长和抑制植物病原菌等综合作用的细菌群，简称PGPR）。
2、枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）
枯草芽孢杆菌是一种嗜温性的好氧产芽孢的革兰氏阳性杆状细菌，能够产生耐热、耐旱、抗紫外线和有机溶剂的内生孢子，其抑制植物病原菌的范围很广，包括根部病害、枝干病害、叶、花部病害和收获后果品病害，是一种理想的生防微生物。广泛分布在土壤及腐败的有机物中，易在枯草浸汁中繁殖，故名。枯草芽孢杆菌菌体生长过程中产生的枯草菌素、多粘菌素、制霉菌素、短杆菌肽等活性物质，这些活性物质对致病菌或内源性感染的条件致病菌有明显的抑制作用。
3、解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)
解淀粉芽孢杆菌为芽孢杆菌属，是一种与枯草芽孢杆菌亲缘性很高的细菌，其在生长过程中可以产生一系列能够抑制真菌和细菌活性的代谢物。解淀粉芽孢杆菌在自然界中分布广泛，具有丰富的自身代谢产物，分泌的抗生素、抗菌蛋白或多肽类物质等起到较好的生物防治效果。目前，解淀粉芽孢杆菌已用于蔬菜保鲜、工业酶生产及环境保护等众多领域，但在果蔬保鲜中的研究应用相对较少。
4、地衣芽孢杆菌（bacillus licheniformis）
地衣芽孢杆菌是一种革兰氏阳性腐生性微生物，广泛分布于土壤和其它自然环境中，具有耐热、酶系丰富、产酶量更高和安全等诸多优良特性,被认为是较理想的工业生产菌株。与枯草芽孢杆菌相比，地衣芽孢杆菌生长温度高5～7℃；其次，其生长速率适中，容易使刚跨膜的未合适折叠得蛋白充分折叠；此外，地衣芽孢杆菌分泌蛋白至培养基中的能力大约是枯草芽孢杆菌的2倍，异源蛋白表达水平已报道达到20～25mg/ml，为所见报道的所有芽孢杆菌表达水平最高者。地衣芽孢杆菌是我国农业部2003年318号公告批准使用的饲料级菌株之一。
5、侧孢短芽孢杆菌（Brevibacillus laterosporus）
目前，国内外已报道侧孢短芽孢杆菌具有抗菌、杀虫、杀线虫、溶磷、降解有机污染物、生产赖氨酸和多种酶类物质等功能。在俄罗斯、美国、日本等国家，该菌主要用于防治临床上已经产生抗药性的革兰氏阳性菌和念珠菌，关于其在植物真菌病害生物防治上的研究很少。我国也开展了一些相关的基础应用研究，主要集中在开发生物杀线剂上。
6、巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)
巨大芽孢杆菌属于芽孢杆菌属，是一种好氧产芽孢的革兰氏阳性细菌，菌体直径大于1.0微米，俗称“大芽孢”菌，是一种有益的土壤细菌。
巨大芽孢杆菌已被证实是一种有效的解磷促钾细菌，能分解土壤中的无机磷、吸附态有机磷，进而提高其肥力乃至作物产量。巨大芽孢杆菌属于微生物肥料中的常用菌种之一，可在作物根际定殖，并能将土壤中的磷、钾转化为速效磷、速效钾，进而提高土壤肥力。同时，菌体溶解后所释放出的可溶性磷钾能促进作物对上述营养成分的吸收利用。巨大芽孢杆菌可防治不同植物的细菌和真菌病害（如烟草灰霉病、水稻纹枯病、毛竹枯梢病、香蕉灰斑病等），其本质上是一种抑菌普较广的生防菌株。此外，秦健经研究发现，巨大芽孢杆菌可产生一种名为伊枯草菌素的抑菌物质，其在多种环境下具有较为稳定的抑菌活性。巨大芽孢杆菌能降解一些顽固的难降解的杀虫剂,因此对环境具有十分重要的作用。前期研究中发现巨大芽孢杆菌可增加土壤镉（Cd）的有效性，但对其活化过程及机理并不清楚。
7、固氮类芽孢杆菌属(Paenibacillus)
固氮类芽孢杆菌是一类能产生芽孢，具有固氮能力的革兰氏阳性细菌。这类菌除固氮活性和抗逆力强外，有些菌株还具有促进植物生长，对植物病原菌有抑制作用，耐贮藏等特点，被认为是制备微生物肥料的优良菌种之一。固氮类芽孢杆菌属于非共生固氮菌，可以广泛定植在多种植物的根部，甚至进入植物的根、茎及叶，但不形成根瘤，其固氮作用的发挥不受植物种类的限制。
8、苏云金芽孢杆菌（Bacillus thuringiensis 简称Bt）
Bt属芽孢菌，能产生晶体是它区别于其他芽孢杆菌的标志。按照早期苏云金芽孢杆菌的作用机制，对不同昆虫有特异毒性的伴孢晶体（parasporal crystal）被昆虫吞食后，在昆虫中肠特殊pH条件下被溶解释放出杀虫晶体蛋白（ICPs）。然后，在中肠拟胰蛋白酶的作用下，通过剪切被激活。激活的ICPs特异地与中肠上皮细胞受体结合，从而使细胞通透性破坏，最后导致膜穿孔，使整个细胞代谢失去平衡而导致昆虫死亡。苏云金芽孢杆菌制剂克服了传统化学农药污染环境、危害人畜、易产生抗性等缺点,具有选择性强、安全、原料简单等优点,是目前世界上用途最广、产量最大的微生物杀虫剂,占微生物杀虫剂总量的90％~95％,主要用来防治鳞翅目、双翅目和鞘翅目的某些种类的害虫。近年来又发现Bt对其它目(如膜翅目、同翅目、直翅目、食毛目、虱目和蚤目)昆虫以及吸虫、鞭毛虫、线虫、蜱螨、原生动物有活性,杀虫谱扩大到昆虫纲的9个目。然而迄今为止,已经发现许多昆虫能够对Bt产生抗性。
9、甲基营养型芽孢杆菌(Bacillus methylotrophicus)
甲基营养型芽孢杆菌是Munusany Madhaiyan等人2010年报道的新种，作为芽孢杆菌属的一员，甲基营养型芽孢杆菌作为生防菌的研究越来越多，其在农作物病害生物防治领域正扮演着越来越重要的角色。
10、环状芽孢杆菌菌(Bacillus circulans)
属于一种硅酸盐细菌，功能类似胶冻样类芽孢杆菌。
11、蜡样芽孢杆菌（Bacillus cereus）
蜡样芽孢杆菌分布广泛，常见于土壤、灰尘和污水中，在植物性食品和许多生熟食品中也常见；是一种好氧性、在厌氧情况下也可很好生长的革兰氏阳性杆菌。蜡样芽孢杆菌是条件致病菌，最常见的是通过产生腹泻毒素和呕吐毒素导致食物中毒。偶尔能通过菌体感染引起人的眼部疾病、心内膜炎、脑膜炎和菌血症等疾病。众多研究发现，蜡样芽孢杆菌是土壤中优势菌，对植物根际有促生、防病等功效，属于目前研究得比较多的植物根际促生菌。
12、多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)
多粘类芽孢杆菌对人或动植物没有致病性，某些菌株可产生如抗生素、拮抗蛋白、植物激素、酶、絮凝剂等多种生物活性物质。这些活性物质大多为蛋白质、多糖、多肽等。多粘类芽孢杆菌产生的抗菌物质按其物质类型及分子大小可分为小分子的多肽抗生素类、大分子的拮抗蛋白(酶)类等。这些抗菌物质性质比较稳定,如耐高温、高压,对酸碱稳定,对蛋白酶不敏感等。这些活性物质在植物病害防治以及人和动物疾病治疗方面具有诱人的应用前景。由于其诱人的应用前景,美国环保署(EPA)将它列为可商业上应用的微生物之一,我国农业部也将其列为免做安全鉴定的一级菌种。
二、木霉菌
木霉菌（ Trichoderma spp．）属于半知菌类的丝孢纲，丛梗孢目，丛梗孢科，广泛存在于土壤、根围、叶围、种子和球茎等生态环境中。1932年，Weindling 发现木素木霉（ Trichoderma lignorum） 可以寄生于多种植物病原真菌，建议将该菌用于土传植物病害的生物防治，木霉菌生防研究工作从此开始。 由于木霉菌的广泛适应性、广谱性及多机制性，一直是植病生防学家研究的重点对象。 据报道，木霉菌对多种重要植物病原真菌有作用，如腐霉菌、轮枝菌、镰刀菌、长孺孢菌、交链孢菌、丝核菌、葡萄孢菌等。 据不完全统计，木霉菌至少对 18属 29种病原真菌表现拮抗活性。 木霉菌的防治范围很广泛，主要是用于植物土传真菌病害的防治，有棉花枯黄萎病、猝倒病、立枯病、小麦全蚀病、纹枯病、各种蔬菜的苗期病害等。
13、绿色木霉(Trichoderma viride)
绿色木霉是一种资源丰富的拮抗微生物，在植病生防中具有重要的、不可忽视的作用。它的作用机制有以下几种：产生抗生素；重寄生作用，这是木霉菌作为拮抗菌最重要的机制；溶菌作用；竞争作用（主要为对生存空间和营养的竞争）。很多研究表明：绿色木霉的防病机制主要是重寄生作用。绿色木霉是所产纤维素酶活性最高的菌株之一。绿色木霉产生的纤维素酶能将植物纤维素分解为葡萄糖，能破坏植物细胞壁，使其释放蛋白体、淀粉等营养成分，能消除饲料中淀粉多糖的抗营养作用，提高饲料利用率和畜禽生产性能。
14、哈茨木霉（Trichoderma harzianum）
哈茨木霉菌是一种广泛应用于植物真菌病害防治的菌寄生真菌，它至少可寄生于18个属中的29种植物病原真菌，如腐霉菌、镰刀菌、长孺抱菌、炭疽菌等。哈茨木霉菌主要通过识别寄主后缠绕寄主真菌的菌丝，随后产生细胞壁降解酶和抗生素以及对空间和营养的竞争机制达到防治植物病原菌的目的。
15、棘孢木霉（Trichoderma asperellum）
目前，已获得了对蔬菜上常见病害的病原菌具有较强抑菌活性的生防棘孢木霉菌Ｌ4，棘孢木霉Ｌ4是通过竞争和抗生双重作用有效抑制立枯丝核菌菌丝的生长。棘孢木霉Ｌ4发酵液中含有某类抑菌物质且此活性物质耐高温，不同于其它一些抗菌肽类物质，还需作进一步研究。
三、链霉菌
大多数链霉菌是生活在土壤中的放线菌，属于革兰氏阳性菌，基因组的鸟嘌呤与胞嘧啶（G ＋C） 含量非常高，它们具有复杂的形态分化和次级代谢过程，能产生多种具有生物活性的次级代谢产物，如抗生素、免疫抑制剂、杀虫剂和多种胞外水解酶。其中尤以产抗生素的能力最为突出，在目前已知的上万种抗生素中，有70％以上是由链霉菌产生的。
16、泾阳链霉菌（Streptomyces jingyangensis）
泾阳链霉菌是一种放线菌，俗称“5406”。泾阳链霉菌的代谢活动能促进有机物分解，使养分有效化，同时能释放抗菌物质，从而能有效地防止多种作物病虫害，并能产生刺激植物生长的激素，它还能促进土壤团聚体的形成，具有促进腐殖质的形成和产生多糖的能力。这种抗生菌已在多种农作物上广泛使用。泾阳链霉菌发酵液和菌丝浸提液处理后，作物感染虫害几率下降，已感染作物生长状况良好；发酵液和菌丝浸提液处理后的小菜蛾、青菜蜗牛虫口减退率可达100%，拒食率达80%；泾阳链霉菌代谢产物对作物的病虫有较强的防治作用，具有开发成新型微生物农药的潜力。
17、弗氏链霉菌（Streptomyces fradiae）
通过对发酵液抑菌活性的研究表明，弗氏链霉菌S-221变种发酵液对被测植物病原菌均有抑制作用，其中对富贵竹炭疽病菌水稻纹枯病菌、车前草菌核病菌、棉花黄萎病菌的抑制作用尤为突出。对水稻菌核病菌、柑桔脂肪病菌、紫荆炭疽病菌、车前草穗枯病菌、小麦赤霉病菌、烟草赤星病菌、葡萄炭疽病菌也有不同程度的抑制。这为发酵液开发成农用抗生素提供了数据。
18、微白黄链霉菌（Streptomyces albidoflavus）
微白黄链霉菌虽是链霉菌属目前发现的重要抗菌物种之一，且国内外已有研究发现该物种可产生多种次级代谢产物（如：聚酮合酶途径来源的四环素类抗生素和多烯大环内酯类；非核糖体肽合成酶途径的环六肽类似物和挥发萜类物质；胰蛋白酶等），不仅对尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum）、串珠镰刀菌（Fusarium moniliforme）、番茄灰霉病菌（Botrytis cinerea）、红豆草壳二孢叶斑黑茎病菌（Ascochytaonobrychidis）和水稻稻瘟病菌（Magnaporthe oryzae）等多种病原具有良好抑菌活性，而且可产生角蛋白酶高效降解羽毛、抗须毛癣菌（Tricophyton mentagrophytes）、用于重金属回收和环境修复等，但不同来源菌株抑菌活性大小、抗真菌特性、抗菌物质种类、发酵条件和生物学作用等存在一定差异。微白黄链霉菌（S.albidoflavus）G-1抗菌物质对马铃薯早疫病菌、小麦赤霉病菌、西瓜枯萎病菌、辣椒枯萎病菌、黄瓜疫霉病菌和桃褐腐病菌抑菌率可达75%，而且在紫外照射24h、80℃高温、pH值3-13和稀释100倍条件下仍可保持70%以上抑菌活性。
四、其它菌剂
19、黑曲霉(Aspergillus niger)
黑曲霉对含钾矿物的解钾作用是一种对缺钾环境的适应机制，在这个过程中，黑曲霉菌株获得生命活动必需养料，客观上造成矿物被风化。黑曲霉对含钾矿物的解钾过程是依靠多因素的协同作用导致的综合效果：１）不断增殖的黑曲霉通过分泌多糖，吸附、包裹含钾矿物颗粒，形成较为封闭的真菌－矿物聚集体，该聚集体的形成使菌丝和矿物颗粒充分接触；２）黑曲霉菌丝对含钾矿物表面产生机械破坏作用，从矿物表面裂缝或棱角等脆弱的部位慢慢延伸到矿物晶格内部，导致矿物晶格变形或破坏；３）黑曲霉对钾离子的主动吸收促进钾离子进一步释放；４）黑曲霉分泌的多糖、蛋白质、有机酸等具有对含钾矿物风化的能力，这与它们都具有络合基团有关。形成络合物可降低含钾矿物水解反应的活化能，通过键极化作用可破坏含钾矿物Ｓｉ－Ｏ等键的稳定性，加速对含钾矿物的化学降解作用；５）黑曲霉分泌物相互堆积、混合改变了黑曲霉作用含钾矿物的微环境—酸性环境，是一种有机环境，可破坏矿物内部原有的平衡，影响矿物的稳定性，有利于使含钾矿物晶格结构被破坏并释放出钾离子。
20、淡紫拟青霉（Paecilomyces lilacinus）
Jatata等（1979）最早报道了淡紫拟青霉，以下简称PL，可作为根结线虫卵和胞囊线虫卵的有效寄生菌，在实验室测试中5天可破坏南方根结线虫卵的胚胎。秘鲁的田间试验更加证实了其防治南方根结线虫和半穿刺线虫的效果。所有田间试验都证明PL对防治线虫有效，最明显的效果是柑桔和柠檬，经这种真菌处理的柠檬树的半穿刺线虫虫口密度降低了，产量明显提高。以后许多国家相继对的防治效果进行试验，至1986年已有60多个国家在试验该菌。结果表明能够防治爪哇根结线虫和南方根结线虫，增加番茄、大豆和黑胡椒等多种农作物的产量，对咖啡树也有稳定的效果。
21、球毛壳菌（Chaetomium globosum）
球毛壳菌ND35菌株为从健康毛白杨中分离的优势内生真菌，高建锋等（2010）研究结果表明，该菌株寄主植物范围广，定殖能力强，菌丝在植物体内蔓延迅速，有可能伴随植株完成整个生命周期，与植物形成互惠共生关系。印敬明（2007）研究结果表明，球毛壳菌ND35菌株对番茄有一定的促生增产作用，另对多种植物生长均具有明显的促进作用（刘畅等，2011；米士伟等，2011）。经检测分析该菌株对动植物和环境安全无害（高建锋等，2010）。余新燕等（2009）和孟庆果等（2010）的研究结果均表明，球毛壳菌为优良的生防菌株。
22、嗜硫小红卵菌
2.0亿CFU/mL嗜硫小红卵菌HNI-1悬浮剂防治对象为番茄根结线虫和番茄花叶病。番茄根结线虫防治选择番茄移栽时进行灌根处理，每季使用2～3次，用量400～600mL/667m2；番茄花叶病防治选择发病前或发病初期，采用喷雾方式，每季使用2～3次,，用量180～240mL/667m2。该制剂为纯生物制剂,使用后未见药害发生；对捕食天敌、寄生天敌低毒或无影响。
23、苜蓿根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)
苜蓿根瘤菌具有固氮作用，研究又证明苜蓿根瘤菌具有较强的溶解有机磷能力和分泌IAA能力，表明苜蓿根瘤菌的促生作用是多功能性的。固氮、溶磷、分泌植物生长素，其单独作用是促进或刺激植物生长，但各促生功能间的交互作用或互作效应尚不清楚，如何集成和合理组装3个功能，提高其互作效应，将成为今后研究的新课题。因此，对苜蓿根瘤菌的促生机理需要作进一步的探讨。
24、类球红细菌（Rhodobacter sphaeroides）
类球红细菌属于细菌域中紫色细菌群的α亚群，具有广泛的代谢方式，可以在多种生长条件下生长。如它具有广泛的能量代谢机制，包括光合作用、无机营养、好氧和厌氧呼吸等。它还可以固定氮分子，合成重要生物活性物质四吡咯（tetrapyrroles）、叶绿素（chlorophylls）、血红素（heme）、维生素B12等。大量研究文献表明，类球红细菌已经成为一种非常有工业化开发潜力的微生物。已有多篇文章报道了利用类球红细菌发酵生产5-氨基乙酰丙酸（ALA）；ALA可促进植物叶绿素合成，增强植物抗逆性，促进植物生长。研究表明，该菌株在水溶液中能够快速矿化敌敌畏，在pH6.9～7.5、温度20～50℃条件下，在5×108CFU/mL的类球红细菌稀释液中，400mg/L的敌敌畏在12h内降解率达到98％以上。该菌株发酵液的稀释液喷洒到幼苗期的白菜叶片上，能够显著加快残留敌敌畏降解速度，显示出其在无公害农产品生产中的应用潜力。
25、膜醭毕赤酵母(Pichia membranefaciens)
膜醭毕赤酵母能有效的抑制甜樱桃、桃、油桃、枇杷、苹果、柑橘等果实采后的Alternaria alternata、Penicillium expansum、Botrytis cinerea、Rhizopus stolonifer、Penicillium digitatum、Penicillium italicum等多种真菌，诱导果实中过氧化物酶(peroxidase，POD)、苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase，PAL)、几丁质酶(chitinase，CHI)和β-1,3-葡聚糖酶(β-1,3-glucanase，GLU)等活性显著改变。
26、荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)
荧光假单胞菌细胞有多根极生鞭毛，可水解明胶，不产生绿脓菌素，氧化酶反应阳性，精氨酸双水解酶阳性，产生黄绿色荧光色素，不需要生长因子，能利用葡萄糖和芳香族化合物生长，不利用淀粉，细胞可为溶解，最高生长温度为35-37℃。荧光假单胞菌对多种植物病害具有防治作用，它首先在植物根际定殖，然后靠噬铁素对铁离子（Fe3+）的竞争和抗生素的拮抗作用抑制病原菌的生长发育，保护植物体免受病菌危害。
德德沐农业小编总结：
能够应用于农业生产的微生物非常多，本文仅列举了一些较常见的菌种，不同属的功能菌其特点不同，相同属的菌种有一些共同点，但也存在一些差异，就是同一菌种，不同株型也存在生物防治效果的不同。选择菌剂时要考虑当地的气候、土壤以及作物特点，菌剂和菌剂之间的复配，菌剂和化学药剂的复配，菌剂的存活条件等。减少化学农药及化肥的投入是大势所趋，生物制剂的应用会越来越受欢迎。期待大家一起探讨！
